Katedra Metod Matematycznych i Statystycznych

Sieć kompetencji Katedra Metod Matematycznych i Statystycznych

Katedra Metod Matematycznych i Statystycznych

OGÓLNA TEMATYKA DZIAŁALNOŚCI NAUKOWO-BADAWCZEJ:

analiza statystyczna w modelach wielopoziomowo wielowymiarowych - Nowoczesne techniki doświadczalne stosowane w wielu dziedzinach nauki pozwalają na obserwację wielopoziomowo wielowymiarowych danych (wiele cech mierzonych w różnych punktach czasowych, różnych geo-lokalizacjach). Metodyka analizy takich doświadczeń wymusza badania dotyczące redukcji liczby parametrów w modelach statystycznych, w których liczba nieznanych parametrów może przekraczać rozmiar próby. W celu redukcji liczby parametrów stosowanych modeli opracowywane są metody wyboru najlepiej dopasowanych struktur kowariancyjnych oraz struktur wyrażających wartości oczekiwane. Celem opracowania jest metodyka wyboru adekwatnego modelu statystycznego oraz efektywnej estymacji jego parametrów, a w konsekwencji efektywne wykorzystanie informacji zawartej w zbiorze danych. Realizacja badań powinna przyczynić się do uzupełnienia luki między wynikami teoretycznymi a zapotrzebowaniem na nie w badaniach stosowanych
modelowanie matematyczne procesów środowiskowych - Rozpoznawane są znane i proponowane nowe elementy teorii modelowania matematycznego badań środowiskowych na etapie planowania doświadczeń jak i interpretacji wyników. W szczególności: analiza ekologicznego i przestrzennego modelu krajobrazu, weryfikacja wątpliwości związanych z zastosowaniem makrofitów w monitoringu z opracowaniem metodyki rozpoznawania zmienności parametrów charakteryzujących rośliny rzeczne w gradiencie troficznym, ocena zależności między liczbą niezbędnych gatunków makrofitów wykrytych na stanowisku a stopniem wyspecjalizowania się poszczególnych taksonów pod względem preferencji wybranych warunków środowiskowych związanych z trofią wody. Zastosowanie standaryzacji nierównej liczby próbek (rarefakcji) i predykcji rzeczywistej różnorodności z uwzględnieniem spodziewanej liczby gatunków niewykrytych przez próbkowanie
projektowanie układów eksperymentalnych na skalę genomu - Opracowywanie metod statystycznych i narzędzi bioinformatycznych do interpretacji oraz integracji wielu typów danych w skali genomu, analiza statystyczna danych genetycznych zawartych w mikromacierzach oraz danych pochodzących z głębokiego sekwencjonowania
badania mające na celu pełne wykorzystanie działania technologii generowania danych genetycznych - Analizowane są zastosowania algorytmów wykorzystywanych do przetwarzania danych. Rozwijana jest metodyka statystycznej analizy danych i rozwiązywanie zagadnień w oparciu o pakiety R, Statistica, SciLab. Prowadzona jest analiza czynników determinujących dobór odpowiedniego modelu do analizowanego problemu
programowanie metod statystycznych oraz opracowywanie metodyki planowania i analizy doświadczeń - Omawiane analizy dotyczą wyników badań obejmujących doświadczenia biologiczne, genetyczne, hodowlane, odpornościowe, opornościowe roślin i zwierząt, bioróżnorodności, związane z przeżywalnością, rozrodem i dobrostanem populacji, gleby, drzew, nowych genotypów roślin uprawnych, liczebności mikrostawonogów, zwierząt leśnych, parametrów krwi sportowców, wyników testów wysiłkowych sportowców. Metodyka analiz wykorzystuje m. in. na modele jedno- i wielowymiarowe, modele progowe, metody bayesowskie
teoretyczne podstawy wyznaczania parametrów w modelach genetycznych i hodowlanych - Opracowywanie estymatorów na podstawie obserwacji tylko fenotypowych oraz z uwzględnieniem informacji genotypowej wnoszonej przez markery molekularne, opracowywanie metod analizy interakcji genotypowo-środowiskowej i metod estymacji parametru stabilności genotypów
analiza problemów ochrony środowiska - Przedstawianie rozwiązań problemów związanych z kolizjami ssaków leśnych ze środkami komunikacji. Statystyczna ocena wzrostu i akumulacji pierwiastków w owocnikach grzybów. Propozycja racjonalnego i ekologicznie opłacalnego wykorzystania osadu w rolnictwie i środowisku, ocena wpływu wybranych biostymulatorów i nawozów dolistnych

KONTAKT DO KATEDRY:

Imię i nazwisko osoby odpowiedzialnej za współpracę:

dr hab. Agnieszka Łacka

E-mail: agnieszka.lacka@up.poznan.pl

Telefon 1: 61-848-7141
Telefon 2: 61-848-7140 (sekretariat)

Adres: ul. Wojska Polskiego 28, 60-637 Poznań

www: http://merlin.up.poznan.pl/kmmis2/

ZLECONE BADANIA (badania naukowe i prace rozwojowe, opinie, analizy, ekspertyzy):

01.09 - 30.11.2017, Kierownik: Jan Bocianowski, Zleceniodawca: IHAR-PIB Poznań, Tytuł: „(1) Wyznaczanie wartości podobieństw i dystansów genetycznych w obrębie kolekcji PB16 genotypów rzepaku przy użyciu markerów około 70 loci mikrosatelitarnych oraz 10 kombinacji starterów w analizie markerami AFLP, oraz (2) Przeprowadzenie analiz asocjacyjnych pomiędzy określonymi cechami fenologicznymi, fenotypowymi i biochemicznymi kolekcji PB16 a występowaniem markerów typu AFLP (10 kombinacji starterów) około 70 loci markerów mikrosatelitarnych – w ramach tematu 4-2-01-4-01-kierownik tematu: prof. dr hab. Iwona Bartkowiak-Broda”
22.08 - 30.11.2018, Kierownik: Jan Bocianowski, Zleceniodawca: IHAR-PIB Poznań, Tytuł: „(1) Wyznaczanie wartości podobieństw i dystansów genetycznych w obrębie kolekcji PB17-20 genotypów rzepaku przy użyciu markerów około 70 loci mikrosatelitarnych oraz (2) przeprowadzenie analiz asocjacyjnych pomiędzy określonymi cechami fenotypowymi kolekcji PB14-17, a występowaniem markerów typu AFLP (10 kombinacji starterów) około 70 loci markerów mikrosatelitarnych, opracowanie statystyczne uzyskanych wyników badań z 1 cyklu badań (kolekcja PB14-17 – w ramach tematu 4-2-01-4-01–kierownik tematu: prof. dr hab. Iwona Bartkowiak- Broda.”
02.09 - 29.11.2019, Kierownik: Jan Bocianowski, Zleceniodawca: IHAR-PIB Poznań, Tytuł: „Przeprowadzenie analiz asocjacyjnych pomiędzy określonymi 7 cechami fenotypowymi uzyskanymi w 4 środowiskach i markerami molekularnymi STR, AFLP kolekcji PB17-20 – w ramach tematu 4-2-01-4-01–kierownik tematu: prof. dr hab. Iwona Bartkowiak-Broda.”
02.09 - 30.10.2020, Kierownik: Jan Bocianowski, Zleceniodawca: IHAR-PIB Poznań, Tytuł: „Opracowanie statystyczne uzyskanych wyników badań w II serii doświadczeń(3. rok badań kolekcji PB17-20), (temat badawczy 4-2-01-4-01), analiza interakcji genotypowo-środowiskowej; Przeprowadzenie analiz asocjacyjnych pomiędzy określonymi cechami feno-typowymi kolekcji PB17-20, a występowaniem markerów typu AFLP (10 kombinacji starterów) oraz około 85 loci STR (temat badawczy 4-2-01-4-01) – kierownik tematu: prof. dr hab. Iwona Bartkowiak- Broda.”
02.09 - 30.10.2020, Kierownik: Jan Bocianowski, Zleceniodawca: IHAR-PIB Poznań, Tytuł: „Opracowanie statystyczne wyników badań realizowanych w ramach PW-4.3; – kierownik tematu: prof. dr hab. Iwona Bartkowiak- Broda.”
ekspertyzy (Jan Bocianowski)

DZIAŁALNOŚĆ SZKOLENIOWA:

30.11-02.12.2018 ANALIZA DANYCH RNA-SEQ W R - Wydział Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Szabelska-Beresewicz A., Zyprych-Walczak J
20.04-22.04.2018 ANALIZA I WIZUALIZACJA DANYCH BIOLOGICZNYCH W JĘZYKU R - Wydział Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Szabelska-Beresewicz A., Zyprych-Walczak J
statystyczna analiza danych
obsługa pakietów i programów: R, Statistica, MapInfo, Scilab

INNE AKTYWNOŚCI:

Jan Bocianowski: Recenzja grantu: „Stability and Functions of Soil Carbon in Agroecosystems of Russia (CarboRus)” Expertise task № ET-20201006-56441. Application number: 2020-220-08-371. Host organization: University of Tyumen. Place of employment (full name of the organization): Georg-August University of Göttingen, Germany Head of 2 departments: - Dept. of Soil Science of Temperate Ecosystems, - Dept. of Agricultural Soil Science
organizacja konferencji
patent numer:PL420318 zgłoszenie z dnia 27.01.2017. Tytuł: HUMAN OVARIAN CANCER CELL CULTURE MODEL FOR PACLITAXELINDUCED INVERSE RESISTANCE TO PACLITAXEL AND CISPLATIN AND USE THEREOF. Kierownik: dr n. med. Jolanta Szenajch, Wojskowy Instytut Medyczny, Warszawa

SŁOWA KLUCZOWE: analiza statystyczna, układy eksperymentalne, programowanie metod statystycznych, sieci neuronowe, modele językowe, modele genetyczne i hodowlane.

Powrót