OGÓLNA TEMATYKA DZIAŁALNOŚCI NAUKOWO-BADAWCZEJ:

  • podłoże cytogenetyczne i molekularne chorób i wad rozwojowych zwierząt
  • genomika i epigenomika otłuszczenia/otyłości, nowotworów
  • podłoże genetyczne zmienności cech składu mleka klaczy
  • czynniki genetyczne i epigenetyczne warunkujące zmienność umaszczeń koni
  • modyfikacje genetyczne z wykorzystaniem techniki CRISPR/Cas9
  • analiza ekspresji genów - RT-qPCR, RNA-seq
  • analiza poziomu metylacji DNA (pyrosekwencjonowanie)
  • globalna analiza transkryptomiczna - RNA-seq oraz scRNA-seq (na poziomie pojedynczych komórek)
  • bioinformatyczna analiza sekwencji DNA na podstawie sekwencjonowania nowej generacji (NGS)
  • badania nutrigenomiczne
  • architektura jądra interfazowego
  • doskonalenie genetyczne z wykorzystaniem narzędzi informatycznych
  • ocena wartości hodowlanej i optymalizacja programów hodowlanych
  • selekcja genomowa
  • inbred oraz strategie doboru zwierząt do kojarzeń
  • program ochrony zasobów genetycznych
  • monitorowanie różnorodności genetycznej w rasach koni objętych programami hodowli zachowawczej
  • analiza wpływu hodowli i genotypów zwierząt gospodarskich na procesy związane z ociepleniem klimatu
  • wspomagany rozród zwierząt (zapłodnienie pozaustrojowe - IVF, embryo transfer - ET)
  • analiza potencjału rozwojowego oocytów bydła, świni, kota domowego
  • analiza jakości plemników zwierząt gospodarskich i laboratoryjnych (CASA)
  • morfokinetyczna analiza rozwoju przedimplantacyjnych zarodków ssaków z użyciem systemów time-laps (Primo Vision)
  • molekularne mechanizmy rozwoju zarodków ssaków (transkryptomika)
  • analiza środowiska wzrostu i rozwoju gamet i zarodków w ocenie jakości (metabolomika)
  • w Katedrze funkcjonuje także Laboratorium Badań Markerów Genetycznych u Koni wyspecjalizowane w badaniach kontroli pochodzenia i identyfikacji koni (https://labkonie.up.poznan.pl/ ).

KONTAKT DO KATEDRY:

Imię i nazwisko osoby odpowiedzialnej za współpracę

Prof. UPP, dr hab. Piotr Pawlak

E-mail: Piotr.pawlak@up.poznan.pl 

Telefon: 61-848-71-48

Adres: ul. Wołyńska 33, 60-637 Poznań

www: https://genetyka.up.poznan.pl/ 

 

 

  

REALIZOWANE PROJEKTY :

LP

TEMAT

ŹRÓDŁO FINANSOWANIA

KIEROWNIK PROJEKTU

E-MAIL DO KIEROWNIKA

OKRES REALIZACJI

1

Identyfikacja mikrobiomu płynu pęcherzykowego u świń rasy Złotnicka Biała oraz linii hybrydowych – badania metagenomiczne

NCN Miniatura

Dr Marcin Ryczek

marcin.ryczek@up.poznan.pl 

10.12.2024-9.06.2026

2

Poszukiwanie optymalnych modeli statystycznych do analizy danych liniowego systemu oceny koni gorącokrwistych

NCN Miniatura

Dr Alicja Borowska

alicja.borowska@up.poznan.pl 

10.12.2024-9.12.205

3

Wyjaśnienie molekularnego podłoża zaburzeń rozwoju płci psów przy pomocy kompleksowej analizy transkryptomu i epigenomu gonad

NCN OPUS

Prof. dr hab. Marek Świtoński

marek.switonski@up.poznan.pl 

21.06.2024-20.06.2027

4

Poznawanie podłoża molekularnego zmienności antygenów erytrocytarnych koni z wykorzystaniem metod serologicznych i genetycznych

NCN OPUS

Prof. UPP dr hab. Jakub Cieślak

jakub.cieslak@up.poznan.pl 

9.06.2023-8.06.2027

5

Rola mitochondriów w kształtowaniu rozwoju zarodków saków, od zapłodnienia do pierwszych sygnałów indukujących różnicowanie komórek

NCN OPUS

Dr hab. Zofia Madeja

zofia.madeja@up.poznan.pl 

2.10.2023-1.10.2027

6

Poszukiwanie podłoża molekularnego różnych form depigmentacji okrywy włosowej koni wybranych ras hodowlanych w Polsce

NCN Preludium

Mgr Weronika Skrzetuska

weronika.mantaj@up.poznan.pl   

5.01.2022-4.01.2027

7

Wpływ suplementacji kwasami z rodziny n-3 na metabolizm lipidów w blastocystach bydła pozyskanych in vivo i in vitro

NCN Opus

Prof. dr hab. Dorota Cieślak

dorota.cieslak@up.poznan.pl  

27.12.2021-26.12.2026

8

Wykorzystanie analizy transkryptomicznej do identyfikacji genów związanych z występowaniem przepuklin pępkowych świń

NCN OPUS

Prof. UPP dr hab. Joanna Nowacka – Woszuk

joanna.nowacka-woszuk@up.poznan.pl  

24.02.2020 – 23.02.2023

9

Dodatek pieprzycy peruwiańskiej (Lepidium meyenii) w żywieniu świń i jej wpływ na gospodarkę lipidową – badanie nutrigenomiczne

NCN Preludium BIS

Prof. UPP dr hab. Joanna Nowacka – Woszuk

joanna.nowacka-woszuk@up.poznan.pl  

01.10.2021 – 30.09.2025

10

Zastosowanie technologii CRISPR-Cas9 do wyjaśnienia czy zmiany architektury jądra interfazowego w trakcie adipogenezy są przyczyną czy skutkiem aktywności transkrypcyjnej genów

NCN Opus

Prof. dr hab. Izabela Szczerbal

izabela.szczerbal@up.poznan.pl  

31.01.2019-30.01.2024

11

Identyfikacja markerów genetycznych i epigenetycznych związanych
z wnętrostwem psów

NCN Opus

Prof. dr hab. Marek Świtoński

marek.switonski@up.poznan.pl  

24.01.2019-23.01.2023

12

Metabolizm kwasów tłuszczowych i glukozy podczas dojrzewania in vitro oocytów bydła i jego wpływ na jakość oocytów oraz zarodków pochodzących z zapłodnienia in vitro

NCN Opus

Prof. UPP Ewelina Warzych-Plejer

ewelina.warzych@up.poznan.pl  

24.07.2018-23.07.2022

13

Parametryczna klasyfikacja jakościowa oocytów oraz zarodków zwierząt z wykorzystaniem techniki lab-on-a-chip oraz metod detekcji spektro- i fluorymetrycznych

NCN Fuga

Dr Patrycja Śniadek

 

1.10.2013-6.08.2019

14

Identyfikacja genetycznych mechanizmów kontrolujących zmienność fenotypową wielkości miotu świń

NCN Sonata

Dr Ewa Sell-Kubiak

ewa.sell-kubiak@up.poznan.pl  

10.08.2017-9.08.2022

15

Udział kwasu arachidonowego w kształtowaniu jakości oocytów świni domowej

NCN Preludium

Mgr Natalia Małyszka-Łukomska

malyszka@up.poznan.pl  

28.07.2017-27.07.2022

16

Identyfikacja markerów otyłości psów przy pomocy sekwencjonowania całogenomowego

NCN Opus

Prof. dr hab. Maciej Szydłowski

maciej.szydlowski@up.poznan.pl  

4.08.2017-3.08.2022

17

Kompleksowa charakterystyka regionów kandydujących w genomie psa dla monogenowych zaburzeń rozwoju płci, oparta o sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) i cyfrowy emulsyjny PCR (ddPCR)

NCN Opus

Prof. dr hab. Marek Świtoński

marek.switonski@up.poznan.pl  

18.07.2017-17.07.2021

18

Identyfikacja molekularnych zjawisk przyczynowych związanych z wczesnym

rozwojem raka jelita grubego u genetycznie zmodyfikowanych świń w locus APC

NCN Sonata

Dr hab. Monika Dragan

monika.dragan@up.poznan.pl  

8.02.2017-7.02.2023

19

Poszukiwanie polimorfizmów  w częściach strukturalnych genów LGB1, LGB2, LALBA konia domowego i ich związek z poziomem ekspresji genów

NCN Preludium

Dr Łukasz Wodas

 

3.02.2017-2.05.2020

20

Kompleksowe podejście do optymalizacji wydajności wykorzystania paszy i ograniczenia negatywnego wpływu na środowisko chowu zwierząt monogastrycznych

ECO-FCE

Prof. dr hab. Tomasz Szwaczkowski

tomasz.szwaczkowski@up.poznan.pl  

1.02.2013-31.01.2017

21

Transkryptom oocytów i blastomerów przedimplantacyjnych zarodków świni w kontekście procesu starzenia

NCN Sonata

Dr hab. Piotr Pawlak

piotr.pawlak@up.poznan.pl  

18.02.2015-17.02. 2018

22

Zintegrowana analiza genomiczno-epigenomiczna świni domowej jako modelu dla dziedzicznych nowotworów jelita grubego człowieka

NCN Harmonia

Prof. dr hab. Marek Świtoński

marek.switonski@up.poznan.pl  

06.06.2014-05.09.2017

23

Genetyczne i środowiskowe uwarunkowania zmienności emisji metanu uwalnianego przez krowy mleczne

NCN Opus

Prof. dr hab. Tomasz Strabel

tomasz.strabel@up.poznan.pl  

24.02.2014-23.02.2017

24

Poszukiwanie markerów genetycznych i epigenetycznych zwiazanych z predyspozycją  psów do rozwoju otyłości

NCN Opus

Prof. dr hab. Marek Świtoński

marek.switonski@up.poznan.pl  

11.03.2014-10.03.2017

25

Wpływ diety ciężarnych samic szczura na dziedziczenie wzorów metylacji DNA potomstwa

NCN Sonata

Prof. UPP dr hab. Joanna Nowacka – Woszuk

joanna.nowacka-woszuk@up.poznan.pl  

14.03.2014-13.03.2018

26

Epigenetyczne mechanizmy kontroli ekspresji genów zaangażowanych w odkładanie tkanki tłuszczowej świni domowej

NCN Sonata Bis

Prof. dr hab. Izabela Szczerbal

izabela.szczerbal@up.poznan.pl  

08.07.2013-07.12.2019

27

Wpływ inhibitorów ścieżek różnicowania komórkowego na rozwój i jakość blastocyst bydła in vitro

NCN Opus

Prof. dr hab. Dorota Cieślak

dorota.cieslak@up.poznan.pl  

25.03.2013-24.03.2017

28

Poszukiwanie genetycznego podłoża zmienności cech o złożonym uwarunkowaniu u koni z wykorzystaniem nowoczesnych metod genomiki strukturalnej i funkcjonalnej. Charakterystyka genomiczna składu mleka klaczy należących do wybranych ras koni

NCN Sonata

Dr hab. Jakub Cieślak

jakub.cieslak@up.poznan.pl  

16.08.2012-15.08.2017

29

Poszukiwanie mutacji warunkującej rozjaśnienie bułane umaszczenia konia domowego

MNiSW Iuventus

Dr hab. Jakub Cieślak

jakub.cieslak@up.poznan.pl  

23.02.2015-22.02.2017


ZLECONE BADANIA (badania naukowe i prace rozwojowe, opinie, analizy, ekspertyzy):

  • badania cytogenetyczne zwierząt w kierunku wykrywania chorób i wad rozwojowych
  • diagnostyka molekularna chorób zwierząt
  • kontrola pochodzenia i identyfikacja koni na podstawie markerów DNA
  • diagnostyka molekularna mutacji kształtujących umaszczenia koni
  • grupy krwi koni oraz poziom przeciwciał w surowicy (konflikt serologiczny)
  • kontrola pochodzenia psów
  • analiza funkcjonalna nasienia rozpłodników diagnozowanych w kierunku płodności (morfokinetyka plemników psa domowego oraz bydła; system CASA – Computer assisted sperm assay)


APARATURA NAUKOWO-BADAWCZA:

  • sekwenatory kapilarne– 3130 Genetic Analyzer, 3500 Genetic Analyzer (Applied Biosystems)
  • sekwenator następnej generacji – MiSeq (Illumina)
  • pirosekwenator PyroMark Q48 Autoprep (Qiagen)
  • aparat do cyfrowego emulsyjnego PCR (ddPCR) (BioRad)
  • termocyclery gradientowe (Biometra, BioRad, Applied Biosystems)
  • PCR w czasie rzeczywistym (Real-time PCR) - Light Cycler 480 (Roche), Light Cycler 96 (Roche), Light Cycler 2.0 (Roche)
  • fluorymetr Qubit 2.0 (Invitrogen)
  • urządzenie do fragmentacji DNA – Bioruptor Plus (Diagenode)
  • aparat do mikroprzepływowej elektroforezy kwasów nukleinowych i białek – Bioanalyzer 2100 (Agilent)
  • aparat do wizualizacji żeli elektroforetycznych i membran hybrydyzacyjnych – ChemiDoc MP Imaging System (BioRad)
  • zamrażarki niskotemperaturowe (Eppendorf, New Brunswick Scientific)
  • Spektrofotometr UV-VIS – Nanodrop 2000 (Thermo Fisher Scientific)
  • inkubatory CO2 (Eppendorf, Thermo Fisher Scientific)
  • inkubator CO2 i O2 (Eppendorf)
  • szafy laminarne (Thermo Fisher Scientific)
  • mikroskopy optyczne (Zeiss, Nikon)
  • mikroskopy stereoskopowe (Olympus, Nikon, Zeiss)
  • mikroskopy fluorescencyjne (Nikon, Zeiss)
  • mikroskop konfokalny LSM 880 AiryScan (Zeiss)
  • mikromanipulator Eppendorf z mikroskopem odwróconym Leica AM6000
  • system do obrazowania rozwoju przedimplantacyjnego zarodka w czasie rzeczywistym –  Primo Vision EVO+ (Vitrolife)
  • aparat do transfekcji komórek pierwotnych oraz linii komórkowych –  4D-Nucleofector (Lonza)
  • system do komputerowej analizy nasienia w systemie CASA – program Sperm Class Analyzer SCA Vet z mikroskopem optycznym OLYMPUS CX41

  

 

SŁOWA KLUCZOWE: etyka zwierząt, epigenetyka, cytogenetyka, chromosomy, choroby genetyczne, diagnostyka molekularna, markery DNA, metylacja DNA, genomika, fenotyp, transkryptomika, genetyka populacji, biotechnologia rozrodu, onkogenetyka, bioinformatyka, doskonalenie genetyczne,  kontrola pochodzenia, ekspresja genów, zapłodnienie in vitro, gamety.

 

KONTAKT

Centrum Innowacji i Transferu Technologii
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu
Kolegium Rungego
ul. Wojska Polskiego 52
60-627 Poznań
Zobacz jak można do nas dojechać
Logo Fundusze Europejskie Inteligentny Rozwój Logo Rzeczpospolita Polska Logo Unia Europejska Europejski Fundusz Rozwoju Regionalnego
Projekt „Inkubator Innowacyjności 4.0” jest współfinansowany ze środków finansowych na naukę w ramach projektu pozakonkursowego „Wsparcie zarządzania badaniami naukowymi i komercjalizacja wyników prac B+R w jednostkach naukowych i przedsiębiorstwach”, realizowanego w ramach Programu Operacyjnego Inteligentny Rozwój 2014-2020 (Działanie 4.4).
Go to top