CIiTT UP w Poznaniu

PROJEKTY REALIZOWANE W CIĄGU OSTATNICH 5 LAT:

• Poszukiwanie markerów molekularnych cech użytkowych roślin i zwierząt
• Diagnostyka molekularna chorób człowieka, zwierząt i roślin
• Przygotowywanie konstrukcji genowych do modyfikacji mikroorganizmów, roślin i zwierząt
• Sekwencjonowanie DNA nowej generacji
• Genotypowanie
• Uzyskiwanie bakterii, roślin i zwierząt jako bioreaktorów do produkcji substancji aktywnych biologicznie
• Ulepszanie cech użytkowych roślin i zwierząt, np. modyfikacja roślin dla potrzeb produkcji etanolu drugiej generacji
• Hodowle komórkowe
• Ocena cytotoksyczności
• Farmakogenomika
• Transgeneza świń dla potrzeb ksenotransplantacji
• Prowadzenie prac z GMM (II kategoria zagrożenia) i GMO w ramach Zakładu Inżynierii Genetycznej

• Aparaty do wysoce sprawnej chromatografii cieczowej Jasco i Agilent Technologies (HPLC) stosowane do analizy związków niskocząsteczkowych, takich jak pochodnych homocysteiny, nukleotydów, związków fenylopropanoidowych.
• Komory laminarne do pracy w warunkach sterylnych z hodowlami mikroorganizmów lub hodowlami komórkowymi. Wykorzystywane są również w przygotowywaniu roślinnych kultur in vitro.
• Analizator wzrostu komórek PANSys 3000 do przyżyciowego monitorowania wielu parametrów w hodowlach komórkowych, umożliwiając precyzyjne dozowanie różnych składników, łącznie z możliwością przyżyciowej obserwacji mikroskopowej. Zapewnia odpowiedne warunki wzrostu, jego monitorowanie wzrostu i ocenę zachowania komórek, w aspekcie cytotoksyczności badanych związków biologicznie czynnych.
• Termocyklery real-time PCR. Stanowią obecnie standardowe wyposażenie laboratoriów związanych z pracami molekularnymi, pozwalając na ocenę ekspresji wybranych sekwencji na poziomie RNA. PCR w czasie rzeczywistym (ang. real-time PCR) jest metodą ilościowego oznaczania DNA.
• Sekwenatory:
  • Sekwenator kapilarny ABI 3500
  • Sekwenator Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer stanowi zaawansowany sprzęt przeznaczany do sekwencjonowania jak i analizy długości fragmentów, z możliwością jednoczesnego odczytu 6 fluorochromów w układzie 8-kapilarnym.
  • Pirosekwenator PyroMark Q48 Autoprep. Umożliwia określenie polimorfizmu DNA w zautomatyzowanym systemie 96-dołkowym. Zastosowanie do genotypowania i analizy metylacji.
  • Sekwenator MiSeq firmy Illumina do sewencjonowania nowej generacji (SNG), pozwala na jednoczesne poznanie setek milionów krótkich sekwencji (ok. 100-400 nt), pozwalając na uzyskanie 1 Gb danych sekwencyjnych w ciągu kilkugodzinnej pracy urządzenia.
  • Nanosekwenator MinION do szybkiej analizy sekwencji z zastosowaniem metod nowej generacji.
  • Stacja robotyczna Biomek FX firmy Beckman Coulter do izolacji i oczyszczania DNA/RNA techniką kulek magnetycznych, wraz z doprowadzaniem do określonych stężeń DNA; składanie reakcji PCR; pipetowanie cieczy w zakresie 1 μl do ok. 3 ml dla zestawu 8-końcówkowego oraz w zakresie 1 μl do 235 μl dla układu 96 dołkowego.
• Mikroskopy:
  • Mikroskop fluorescencyjny AXIOVERT 200 firmy Carl Zeiss podłączony jest do systemu do fotodokumentacji. Mikroskopy przeznaczone do obserwacji hodowli komórkowych zwierząt i człowieka czy komórek roślinnych.
  • Mikroskop Leica DM2000 LED
  • Kriostat CM 1520 Leica
  • Mikroskop optyczny świetlny
  • Zoe Fluorescent Cell Imager do obserwacji komórek
  • Skaner fluorescencji, chemiluminescencji i radioaktywności Typhoon 8600, umożliwiający pracę z próbkami znakowanymi radioaktywnie.
• Cieplarki do hodowli tkankowych (w tym z wytrząsaniem).
• Inkubator z wytrząsaniem
• Zestaw do próżniowego zagęszczania próbek Vacuum Concentrator Systems firmy Labconco
• Czytniki do mikropłytek Tecan i Biotek
• Szklarnia
• Pracownie Zakładu Inżynierii Genetycznej do prac z GMO i GMM

• Genotypowanie
• Sekwencjonowanie nowej generacji
• Przygotowywanie konstrukcji genowych i wykrywanie transgenezy
• Hodowle komórkowe
• Ocena cytotoksyczności
• Diagnostyka molekularna roślin, zwierząt i człowieka
• Poszukiwanie markerów genetycznych cech ilościowych
• Ocena metylacji specyficznej
• Izolacja białek/peptydów
• Kultury in vitro roślin

• sekwencjonowanie DNA,
• oznaczanie markerów genetycznych roślin, zwierząt i człowieka,
• określanie pokrewieństwa roślin, zwierząt,
• molekularną identyfikację mikroorganizmów,
• ocena genetycznie modyfikowanej żywności,
• przygotowywanie konstrukcji genowych,
• syntezę rekombinowanych białek,
• autoradiografię i fluorymetrię

W strukturze Katedry Biochemii i Biotechnologii działa Zakład Inżynierii Genetycznej (ZIG) w którym może być prowadzone zamknięte użycie GMM (genetycznie zmodyfikowanych mikroorganizmów, zamknięte użycie GMM zaliczonych do II kategorii zagrożenia) oraz GMO (genetycznie zmodyfikowanych organizmów, zamknięte użycie GMO zaliczonych do I kategorii zagrożenia).opracowywanie koncepcyjnych i technologicznych rozwiązań w celu wytwarzania innowacyjnych produktów spożywczych.